Ementa do Curso
Objetivo Geral:
Proporcionar formação teórico-prática em sistemática molecular, abordando conceitos evolutivos, marcadores moleculares, métodos de inferência filogenética e ferramentas computacionais para análise e interpretação de dados moleculares.Objetivos Educacionais/Aprendizagem:
• Identificar os principais conceitos de sistemática molecular e especiação.
• Diferenciar marcadores moleculares e suas aplicações em estudos taxonômicos e epidemiológicos.
• Aplicar técnicas de análise de sequências de DNA.
• Realizar alinhamentos e preparar arquivos para análises filogenéticas.
• Utilizar softwares de análise filogenética (DNAsp, MEGA, PhyML, IQ-TREE e BEAST).
• Interpretar árvores filogenéticas e resultados de diferentes tipos de árvore.
• Relacionar evidências moleculares a questões de evolução, taxonomia e epidemiologia.
• Diferenciar marcadores moleculares e suas aplicações em estudos taxonômicos e epidemiológicos.
• Aplicar técnicas de análise de sequências de DNA.
• Realizar alinhamentos e preparar arquivos para análises filogenéticas.
• Utilizar softwares de análise filogenética (DNAsp, MEGA, PhyML, IQ-TREE e BEAST).
• Interpretar árvores filogenéticas e resultados de diferentes tipos de árvore.
• Relacionar evidências moleculares a questões de evolução, taxonomia e epidemiologia.
Metodologia:
As aulas teóricas serão realizadas a partir de aulas expositivas, utilizando computador e data show para apresentação de slides e fichas de exercícios. Para as aulas práticas, serão necessários além do data show para apresentação de slides que os alunos levem seus laptops com os seguintes programas instalados: Notepad++(https://notepad-plus-plus.org), Mega12(https://www.megasoftware.net), DNAsp v6 (https://www.ub.edu/dnasp/), Tracer v.1.7 (https://github.com/beast-dev/tracer/releases/tag/v1.7.2), Figtree v.1.4 (https://github.com/rambaut/figtree/releases), BEAST2 (https://www.beast2.org). É importante que a sala tenha acesso à internet.
Justificativa:
Capacitar estudantes para o uso de ferramentas moleculares e computacionais aplicadas à sistemática e à reconstrução filogenética, competências essenciais para pesquisas em biodiversidade, evolução, taxonomia, epidemiologia e vigilância de vetores e parasitos.
Avaliação:
Apresentação oral com slides dos resultados das aulas práticas em forma de projeto científico, seguida de arguição. Para conclusão e certificação, o aluno deverá obter nota acima de 7,0 e participação em ao menos 75% do curso.
Estrutura:
Dia 01: - Fundamentos da Sistemática Molecular (teórico) - Teorias de especiação e conceitos de espécie (teórico) - Introdução a técnicas moleculares e marcadores moleculares (teórico) - Download e organização de dataset, formatos de input de sequências (prático)
Dia 02: - Evolução molecular e métodos de substituição nucleotídica (teórico) - Estimativas de diversidade genética (teórico) - Alinhamento de sequências e análises básicas de diversidade (prático)
Dia 03: - Máxima Verossimilhança e aplicações (teórico) - Inferência bayesiana em filogenias (teórico) - Construção de árvores filogenéticas pelos métodos de máxima verossimilhança (prático) - Avaliação de suporte de ramos (prático)
Dia 04: - Filogeografia e coalescência (teórico) - Inferências bayesianas (prático) - Interpretação de dados e árvores geradas por inferência bayesiana (prático) Dia 05: Apresentação dos alunos e encerramento do curso.