Programação

TÓPICOS PRELIMINARES

- Introdução à genômica de patógenos.
- Introdução à UNIX e Google Colaboratory.
- Formato de arquivos em análises genômicas.
- Controle de qualidade.
- Trimagem de leituras de sequenciamento.
- Mapeamento/alinhamento de leituras de sequenciamento.
- Chamada de variantes e construção de genoma consenso.
- Apresentação de workflows de montagem de genômas virais (ViralFlow e ViralRecon).
- Classificação em linhagens ou genótipos virais.
- Filogenia básica aplicada à vigilância genômica.